První platba po vydání ROPD je zálohová platba, druhá platba po schválení průběžné zprávy v polovině doby inkubace (v případě inkubace Plus se podávají průběžné zprávy 2 a je zde tedy i o jednu platbu více), poslední platba na konci, po schválení závěrečné zprávy. Ano, budeme chtít dokládat faktury, ale vzhledem k tomu, že se jedná o inkubaci a ne dotaci, budou se faktury moci kontrolovat každý měsíc. Firma pak bude mít velmi dobrý přehled o uznatelných nákladech a v rámci kontroly zpráv by se mělo jednat o formalitu a proces bude velmi rychlý. Pokud firma nebude spolupracovat a dávat drobný měsíční report, bude proces delší. Vše záleží na tom, jak bude firma s inkubačním týmem spolupracovat.